马英九将在19日正式上任国民党党主席，为了安定国民党人事，化解竞选时的纠纷，马英九在15日下午拜会身兼台“立法院”院长的国民党副主席王金平。这是两人在国民党主席改选之后首次正式会晤，而会面进行了50分钟。

　　王金平会后表示，他不会续任国民党副主席，但是日后仍会全力协助马英九。马英九形容会面气氛和谐，并且希望王金平继续担任国民党首席副主席，但再度遭婉拒。马英九虽一再强调将继续敦请王担任副主席，但王退出党务意志甚坚，昨日两人会晤被视为是马英九的“最后努力”。

　　有国民党内人士分析，未来马英九入主党中央，王金平固守“立法院”，国民党的“双头新结构”将成形。

　　有分析认为，未来马英九入主国民党中央，王金平将专注“国会议长”角色，折冲朝野领袖之间，挥洒空间更大，未来包括陈水扁与马英九之间可能的互动、国亲协调整合、高度争议性政策的协商，王金平势必将扮演关键角色，马英九也势必与王金平商议许多重大政策，而国民党新的“双龙头结构”，也会就此成形。