但是，接踵而至的三年自然灾害，没能让完成全线初测的青藏铁路开工。尽管如此，中国人修建青藏铁路的准备工作并没有停止。1960年，铁道部科学研究院西北研究所在海拔4700多米的风火山建立了多年冻土观测站，连续测取了1200多万个科研数据。

　　1973年，毛泽东在北京会见尼泊尔国王比兰德拉时，又一次提到进藏铁路建设。周恩来也曾多次指示："全国只有西藏没有铁路，要巩固边疆，开发边疆，发展西藏，从根本上改变西藏的面貌，提高生产力，改善人民的生活，就必须修路。"1974年，全国1700多名科技人员汇聚青海，展开全方位的进藏铁路课题研究。

　　然而，文革浩劫已让中国经济到了崩溃边缘，继续修建进藏铁路，国力无法承受，特别是高原和冻土两大难题难以解决。1978年，青藏铁路全线停工。

　　面对自然灾害和国力不足等困难，中国人修筑进藏铁路的信念并没有动摇。以邓小平同志为核心的党中央第二代领导集体时刻关注着进藏铁路建设。1983年夏天，邓小平在北戴河听取西藏交通发展的工作汇报后，意味深长地说："看来还是要修青藏铁路"。