综合台湾媒体报道，陈水扁在春节发表了有明显“台独”意涵的讲话后，引发岛内外一片反对之声。陈水扁与台当局“行政院长”苏贞昌在大年初二即秘密会晤，之后台当局“行政院”与“国安会”高层及“外交”、“陆委会”密集开会，全面动员危机处理。

　　台湾媒体报道称，陈水扁在春节(1月29日)发表要废除“国统会”与“国统纲领”、并要以“台湾的名义加入联合国”的讲话后，美国国务院随即发表声明，质疑陈水扁废除“国统会”、“国统纲领”和加入联合国的讲话有改变台海现状之虞，华盛顿邮报的标题使用了“美国斥责”的用语。台湾当局感到情况不妙，陈水扁与台当局“行政院长”苏贞昌在大年初二即秘密会晤。

　　随后，苏贞昌指派新任台当局“行政院副院长”蔡英文负责与台当局“总统府”、“国安会”沟通，统一发言口径。蔡英文、台当局“国安会”秘书长邱义仁及与台当局外事主管部门负责人黄志芳扮演“府院”沟通的重要角色，全力降低“府院”潜在不同调的冲突，并在短短数日内将此议题定调。

　　台湾媒体报道称，台当局“外交部长”黄志芳昨晚出面阐述陈水扁讲话的用意，称陈水扁讲话“是属于咨询的性质，并不是马上要进行”，明显有降低陈水扁讲话所带来的冲击的意味。与此同时，台当局透过美国在台协会以及台当局驻美代表处两条管道，持续与美方沟通。台当局“陆委会”今天下午也将举办记者茶叙，说明台当局立场及态度，为此风波定调。

　　据台湾媒体了解，蔡英文昨天下午与邱义仁、黄志芳等人在台当局“外交部”开会；会商后回到“行政院”，将台当局的立场向苏贞昌说明、回报。苏贞昌则在台当局“行政院”听取“陆委会”主委吴钊燮等的报告，并决定由“陆委会”统一对外表达台当局的立场。