针对地检署将高捷不适用“采购法”，而是违反“政府采购法”，将前高雄市长谢长廷列为被告一事，谢长廷亲自撰写“万言答辩状”，并提出15项证据，以证实自己的清白。

　　据台湾东森新闻报道，谢长廷批检察官不了解甄选操作过程，动辄以图利罪起诉公务员，已造成当前公务机关普遍弥漫多做多错，少做少错的风气；他认为检察官办图利案件不应随媒体起舞、甚至怀有政党、省籍成见，泄密通风报信，以满足别有用心的人之企图，而打击认真办事的公务员。

　　谢长廷在答辩状中表示，依照“政府采购法”第六条规定，检察官办理案件，应该洽询主管机关监定；“法务部”在其所公布“办理贪污案件应注意事项”中，也明定要确定公务员有无违背法令，应洽主管机关解释法令。

　　他说，检察官对此案件，并没有询问主管机关的意见，所以他请求洽请由上级主管机关或学者专家来监定。他并提出学界的一份报告，指出“政府采购法”和“奖参条例”两者是分流的概念，不应混淆。

　　谢长廷也感叹，最近“经济部”加工出口区前后任处长潘丁白、周严，都曾遭检察官依图利罪起诉，不但失去职位、也失去名誉、健康、处境令人鼻酸，最后虽都经“最高法院”判决无罪，但对于公务员的名誉、精神已造成不可想象的打击。