据台湾媒体报道，“总统府”对发票一事的说法，前后有三套版本，六月底“台湾红”负责人李慧芬隔海接受媒体访问，表示她在君悦饭店消费的发票被堂姐李碧君拿去给官邸报销，“府方”第一时间不愿证实。随后，即出现“南线项目”的说法，表示不相干的发票，都是从事“秘密外交”的中间人拿来报销的，与“总统府”无关。

　　但耐人寻味的是，所谓“秘密外交”中间人拿发票请款的说法，都是“府方”以不具名方式对外发布的讯息。在“府方”七月十九日正式对外说明“国务机要费”的新闻稿中，也只是强调“相关支出费用皆依规定，据领结报，并无所谓贪渎不法情事。”

　　七月三十一日，陈水扁会见党内“立委”后，也透过立委对外转述表示，发票不是“府方”向李慧芬要的，而是要核销的人向李慧芬要的，与“总统府没关系。民进党大党鞭柯建铭见了陈水扁后，更对外转述表示，“总统府也不知道请款人的发票哪里来的。”

　　但相隔一周，陈水扁八月七日接受陈瑞仁检察官密讯时，就坦承因外交工作所需，曾透过夫人吴淑珍帮忙收集发票报销。然而，就在陈水扁向陈瑞仁检察官据实坦承收集发票情节后，府方还继续巩固“没有对外收集发票”的说法。民进党“立院”党团书记长叶宜津八月十五日还对外表示，“总统府没有搜集发票”、“吴淑珍没向李碧君拿过发票”。

　　更令人啼笑皆非的是，替官邸收集发票的李碧君，八月下旬接受讯问时，可能不知陈水扁已向检察官坦承交代过了，还为了配合“府方”“非直接收集发票”的说法，向检察官表示，她的发票都是交给第三者，而第三者已经“死了”。

　　由“总统府”这一连串的“危机处理”作为看来，尽管“府方”建立了一套对外解释发票来源的说法；只是，“府方”可能万万没有料想到，陈水扁接受侦讯的内容后来会走漏消息，才会在八月七日之后，继续大剌剌地对外表示，“发票都是请款人拿来报销的。”