台北市长马英九陷入“特别费”风波，由于检察官陈瑞仁当时用“特别费”的性质侦办“国务机要费”案，因此民进党内日渐传出：“若马英九无罪，陈水扁更不可能有罪”将两案矛头全指向“制度杀人”。

　　据台湾《中国时报》报道，民进党中执会日前决议成立“‘总统’与‘行政首长’机要费制度研议小组”，今将与“政院”讨论规范“特别费”的核销方式。部分民进党“立委”认为，“国务机要费”应该等同陈水扁的“特别费”，只是位阶不同，“制度化”后，希望能将“国务费”性质视为“总统特别费”。

　　陈水扁“国务机要费”及台北市长马英九特“别费案”，两个案子在政治操作下已逐渐转向为“制度诱人犯罪”的问题。台智库19日在座谈会中，探讨从“国务费”到“特别费”，涉及的“转型正义”问题。

　　与会的民进党“立委”管碧玲认为，“制度诱人于罪”，“若现在不用集体包裹处理，社会将陷入纷争”。

　　民进党目前的操作策略，已逐渐让“国务机要费”和“特别费”划上等号，演变成“制度杀人”。未来是否以此作为为扁脱身的攻防焦点？虽然柯建铭低调表示：“司法上还须由法官认定。”但一旦能向大家说服让“国务机要费”等同“特别费”后，目前构成既成犯要件明确的马英九，若能在检方面前脱身，陈水扁就更有可能过关。