在载人飞船飞行任务中，从航天员进舱、发射入轨、在轨运行、返回着陆至航天员出舱，一旦发生危及航天员安全的险情，航天系统会立即启动应急救生程序和措施，以保障航天员的生命安全。

　　神舟飞船的应急救生主要包括待发射段、发射段大气层内、发射段大气层外、轨道运行段、返回段和着陆后等几个阶段。

　　待发射段：火箭起飞前，如果出现致使性故障时，航天员会立即打开返回舱的舱门，按预定顺序逃出返回舱，通过轨道舱进入逃逸滑道口(或电梯)，下到地下掩体撤离。

　　发射段：从火箭起飞至运载火箭抛整流罩，如果出现应急情况，可通过逃逸飞行器逃逸。这一阶段的应急救生可分为“低中高空大气层内有塔逃逸”“大气层内高空无塔逃逸”和“大气层外应急救生”。

　　运行段：飞船运行期间出现故障可提前或推迟返回。如出现电源分系统故障时，可提前到第2圈返回；如出现第一次调姿故障时，可中止飞船返回程序，推迟一天或两天返回。飞船在轨道运行期间发生紧急故障时，可自主应急返回，即在飞船运行段一旦出现需在6小时内应急返回的情况，航天员可通过操纵仪表键选择应急返回方案并实施。

　　返回段：当飞船在返回时不能建立制动姿态时，航天员从光学瞄准镜和舷窗获取飞船的姿态角，通过姿态控制手柄建立飞船的制动姿态；当飞船变轨发动机工作不正常时，若是一组变轨发动机出现故障，则应启动另一组发动机；如果两组均出现故障，可用8台推力各为150N的发动机制动返回；返回时如果主份伞弹伞舱盖出现故障，回收着陆分系统会将主份伞分离掉并切换至备份伞工作；若返回舱防热舱防热大底未抛掉，着陆反推发动机无法工作，航天员应按下座椅提升键，使座椅提升，以减缓着陆时的震荡。