由来自中国、美国、荷兰、以色列等14个国家300多位科学家组成的“番茄基因组研究国际协作组”,历时8年多完成对栽培番茄全基因组的精细序列分析。这项成果31日以封面文章形式发表于最新一期国际权威学术期刊《自然》。
中国科学家在番茄基因组研究中做出重要贡献:中国科学院遗传与发育生物学研究所李传友、薛勇彪研究员作为中方协调人负责第3号染色体的测序工作;中国农业科学院蔬菜花卉研究所黄三文、杜永臣研究员作为中方协调人负责第11号染色体的测序工作。中国科学家高质量完成番茄基因组测序总任务的1/6,标志着中国是番茄基因组学研究的强国之一,在国际蔬菜基因组研究领域具有国家优势地位。
中科院遗传与发育生物学研究所、中国农科院蔬菜花卉研究所当天在北京举行发布会介绍说,番茄是研究果实发育的经典模式植物,其基因组有12条染色体,约9亿个碱基对。番茄基因组研究国际协作组在解码的番茄基因组中共鉴定出约34727个基因,其中97.4%(33840个)的基因已精确定位到染色体上。协作组同时绘制出栽培番茄祖先种野生醋栗番茄基因组的框架图,两个基因组仅有0.6%的区别。
对栽培番茄和醋栗番茄全基因组的序列测定,是继拟南芥和水稻基因组序列分析之后,科学家通过国际合作完成的又一个高质量模式植物基因组序列分析。这对于不同物种之间的比较基因组学研究具有重要价值,将极大推动番茄乃至包括马铃薯、辣椒、茄子等茄科植物的功能基因组研究,为培育具有高产、优质、抗病虫害、抗逆等优良性状的番茄新品种奠定良好基础,对推动全世界番茄生产有重要意义。同时,基因组序列的获得为在育种中进一步利用野生资源的优异基因提供出有力工具。
2003年11月,由30多个国家参与的国际茄科基因组计划在华盛顿发起成立,并组建由中、美等14国科学家组成的番茄基因组研究国际协作组,开始番茄全基因组的测序工作。鉴于中国科学家在番茄基因组测序任务中的突出表现和重要贡献,国际茄科基因组计划决定2013年在中国举行第10届国际茄科基因组大会。
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