7月12日，南海仲裁案仲裁庭作出非法无效的所谓“最终裁决”。声称中国在9段线范围内主张的历史权利没有法律依据，而南沙群岛的所有海上地物均为礁岩，包括太平岛在内。结果公布后，岛内各界纷纷表示:仲裁荒腔走板，不能接受，两岸面对国际强权的染指，只有共同捍卫这片祖先留下的资产，才对得起历史。
对于仲裁结果造成的恶劣影响，台湾《中国时报》刊载台湾海洋事务与政策协会秘书长王冠雄的文章指出，菲律宾南海仲裁案结果无法让人信服，其后续的检讨更会激烈。
王冠雄认为，今日的裁决势将牵动南海局势朝向紧张态势发展。仲裁结果将对区域政经情势带来重大和深远的影响。
台湾《联合报》发表题为《南海仲裁是荒腔走板的不智判决》的社论指出，这一裁决，对两岸来说都是不可接受的结果，仲裁法庭不仅昧于事实，且偏颇不智，势必治丝益棼，引发南海更多争端。
社论直言，五名仲裁法官，作出如此昧于历史事实及国际现实的判决，可谓既不明智，亦不公平。而如果仲裁者一味为了迎合某方霸权，甚至是心存偏私，却妄想藉此改变南海既有的复杂秩序，恐怕太过天真。
岛内舆论认为，两岸应该共同维护南海领土主权，共同捍卫祖产。
台湾《中国时报》今日发表题为《菲律宾做贼喊抓贼》的评论说，在两岸一家亲，承认“九二共识”的前提下，这张废纸轻如鸿毛，不需一顾。维护中华民族的整体和根本利益，是两岸同胞的共同责任。
评论引用台湾薇阁文教基金会的李传洪的话说:“要让更多的炎黄子孙都理解，两岸一起维护南海这个共有的领海领土家业，刻不容缓。”
台湾《中国时报》社论亦认为，两岸对于南海拥有相同的历史权利主张，面对国际强权的染指，只有共同捍卫这片祖先留下的资产，才对得起历史。
针对仲裁中“南沙群岛的所有海上地物(包括太平岛)均为礁岩”这一结果，台媒纷纷表示无法接受。
台湾《联合报》社论指出，仲裁法院为了作出有利菲律宾的判决，将南沙群岛所有岛礁皆认定为“礁岩”，连太平岛都被贬抑为“礁”，这完全是“指鹿为马”的行径，昧于既存事实，且毫无公信可言，且对台湾极端不公。
社论还说，仲裁否定中国大陆主张的九段线之合法基础，严重损害大陆的权益。尽管美、日等国均认为，中国作为《联合国海洋法公约》的缔约国，必须接受仲裁的约束;但中国大陆早已宣布了三不“不接受、不参与、不承认”，仲裁“不过是废纸一张”。可见，想要借一次仲裁改变南海现状，绝无可能。
蔡英文当局上台以来，对太平岛及南海的态度备受关注，其亲美日的政策，在南海仲裁案结果公布后，也遭到岛内舆论的新一轮批驳。
台湾《旺报》今日刊载台湾“国家政策研究基金会”助理研究员谢志传的文章指出，民进党当局上台之后力推与美日亲近，现在日本人主导的仲裁庭把太平岛降为礁，足见民进党当局的政策失败，美日各有其国家利益，不会因为台湾的支持，就给台湾实质的利益，此次判决就是铁证。
谢志传指出，蔡英文上台至今对于太平岛与南海没有重要政策宣示或是动作，导致太平岛的地位降格，这是无法接受的判决，也是台湾利益受损。
台湾《中国时报》今日发表社论指出，蔡当局应该认清国际强权的实力原则，美国为了遂行其亚太再平衡政策抵制中国崛起，一再拉拢台湾，但是在南海主权争议上显然是以其自身利益为优先，不会顾及台湾的权益。蔡当局如果指望美国，后果很可能如同太平岛的仲裁结果一般。
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