据台湾媒体报道，2008年陈水扁卸任时，一并带走大量机密文件，陈水扁办公室日前行文台当局，表示愿返还全部20箱文件，但开出“阿扁释放后亲自处理”的条件。对此，“府”方要求扁办依法返还，扁办不予理睬，“府”方与律师、专家研商后，决定近日将其移送台北地方法院检察署进行侦办。

　　台当局发言人罗智强表示，由于事涉台湾机密文件档案保全，“府”方已邀请法律专家开会商讨，原则就是依法办理。

　　据了解，扁办早在6月22日就率先出招，发文给特侦组，表示扁办7月20日将搬迁，询问陈水扁卸任时携带的文件、档案应如何处理？“府”方于8月16日曾去文强调依规定，文件、档案留置扁办于法不符，“建请尽速厘清”；扁办8月24日回文称，不知档案内容为何，同时更附带但书，“需等陈水扁解除羁押亲自处理所携出之文件、档案”。8月31日“府”方再发公文强调，要求扁办“文到之日3日内惠复”，但扁办迟迟没有回复，迫使“府”方采取法律行动。