按照景观生态学的基本原理，根据项目区实际和保护建设重点，鄱阳湖国家湿地公园的空间布局为“一城七区”，重点保护“两廊四基质”；实施“十大工程”。其中“一城”是鄱阳湖文化水城；“七区”是指汉池湖水禽栖息地保护与保育区、角丰圩湿地恢复与重建区、珠湖水源湿地保护保育区、白沙洲自然湿地展示区、青山湖人工湿地利用示范区、东湖城市湿地休闲区和管理服务区。“两廊”是指从白沙洲观鸟大堤一直到昌江的防洪大堤，为湿地公园的“绿色廊道”(简称“绿廊”)，从县城出发，沿途过上头湖、青山湖，到达珠湖，为湿地公园的“蓝色廊道”(简称“蓝廊”)。

　　“四基质”分别为“湿地保护保育基质”、“湿地恢复与重建基质”、“湿地可持续利用基质”和“生态旅游基质”，四大基质对湿地公园起着基础性的调控作用。“十大工程”主要指鄱阳湖文化水城建设工程、水禽栖息地保护与保育工程、湿地恢复与重建工程、珠湖水源地保护保育工程、湿地综合利用示范工程、湿地生态旅游发展工程、湿地科研监测与宣教工程、环境保护工程、社区共建共管工程和基础建设工程。