台湾是世界上第一个实行加工食品追溯制度的地区，食品从原料来源、生产养殖、加工制造、运输仓储直到销售全过程中的每个阶段都登记。这种制度下，在市场买一块肉，刷下追溯码，就能知道这头猪出自哪个厂，饲养员是谁。尽管如此，食品安全事故仍频频发生。
究其原因，首先是食品追溯制度只限于生鲜、肉制品、蔬菜和海鲜类，因而混在饮料、药品、糕点里的塑化剂30年间一直逍遥法外。同时，瘦肉精等违禁品主要靠抽检，且惩罚力度相对不高，因而总有黑心商人心存侥幸铤而走险。
下个未爆弹？
食品添加了太多人造物而变得不适食用，其实是全世界的问题。岛内媒体指出，台湾食品安全的标准虽然不算低，但跟欧盟等先进地区比起来还有差距。
台湾要进口美国牛肉还引出了另一个话题。台湾清华大学荣誉退休教授彭明辉日前站出来“揭穿美国食品安全的谎言”，呼吁台当局正视基因改造食品的安全问题，千万别让台湾的食品安全标准跟着美国走。
彭明辉说，从含瘦肉精美牛争议到基改作物大举侵台，其实道理是一样的，美国食品安全早被财团、政府掌控，台湾当局不能照单全收。基改作物产生的致癌风险远高于传统作物，对人体危害远超过美国食品与药物管理局的公告，在许多国家和地区已造成对大豆过敏的人暴增五成，甚至夺走人命，“非得要小心不可”。
台大农艺系教授郭华仁也认为，基改的豆类食品种类众多，可能成为下个食品安全的“未爆弹”，目前从岛外进口的八成大豆、六成玉米全是基改作物，岛内应尽快恢复自产黄豆、大豆种植的比率。
对待基改食品，台湾当局的政策还算谨慎。“农粮署”指出，台湾虽有进口基改食品，但严格禁止种植基改作物，并且还用现金补助奖励农民种植有机大豆、黄豆。
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