据台湾《联合报》报道，国民党荣誉主席连战已发表声明，对马英九被起诉表示遗憾，并表示相信马英九的清廉。台“立法院长”王金平也表示，“我个人相信马主席的操守和品德，但也相信司法。”有亲民党“立委”更痛斥，这是“台湾司法最黑暗的一天”。

　　检察机关安插心腹

　　提前数月开始布局

　　台检方宣布起诉马英九后，岛内舆论齐声为马喊冤。据岛内媒体分析，这起案件自始至终都被陈水扁操控。他先后使出了3招，其中最厉害的是早早在司法机关暗中安插了亲信，甚至马英九身边都可能有他的卧底。

　　“拉马救扁”布下绊子。岛内政论名嘴赵少康指出，台湾“特别费”是“制度陷阱”，“查谁都会有问题”。去年8月，陈水扁陷入“公务机要费”案，民进党便搜罗情报控告马英九贪污“特别费”。据传，马英九“账房先生”余文，以前是陈水扁的秘书，很可能是个“卧底”。此后，民进党政客开始穷追猛打，并指使岛内绿营媒体大肆炒作，甚至还警告检方勿用“严以律阿扁，宽待马英九”的双重标准。

　　“安插心腹”控制司法。据台湾《联合报》分析，马英九“特别费”案有两个关键人物：“检察总长”和主审检察官。这两个人一个是陈水扁的心腹，一个则被民进党操控。

　　今年1月，此案进入关键时期。陈水扁调动行政资源，在“立法院”休会前，匆忙通过了“检察总长”陈聪明的任命，从而全盘掌握了案情进度。而主审检察官侯宽仁，原本获得民众高度评价，但民进党利用侯曾在马英九手下任职之事，大肆炒作侯、马“交情”，把侯逼到了“不得不证明自己”的墙角。

　　“排外护短”集中打马。据报道，按照起诉马英九的标准，台湾6500位“首长”都有问题，民进党“四大天王”更“劣迹累累”。但到目前为止，同样因“特别费”遭到检举的苏贞昌、谢长廷、吕秀莲，以及“司法院长”翁岳生，到现在一点事都没有。

　　岛内舆论称：陈水扁笑得太早

　　据台湾“中央社”报道，相较于马英九因“特别费”案遭起诉的“满腔悲愤”，陈水扁13日晚参加年终聚餐时则是满面春风。陈水扁史无前例地在台上连续唱了“爱拼才会赢”等三首歌曲。媒体形容，陈水扁“心情相当不错”，酒也喝得特别多。

　　可岛内舆论认为，陈水扁可能高兴得太早。据台湾TVBS电视台14日的最新民调显示，61%的民众支持马英九参选“总统”，58%民众相信马英九是清白的。如果在“大选”中马英九是与民进党的苏贞昌对决，支持度分别是62%比20%，对手如果换成谢长廷，支持度则是61%比19%。

　　同时，国际媒体也对此事作了报道，并重点着墨于马的清廉形象。英国《金融时报》说马英九享有“清廉先生”的美名；BBC用“一尘不染”形容马英九；美联社说马英九是“清白、优质的政治人物”。

　　台湾《联合报》14日刊登社论说，如此一来，民进党在2008年寻求胜选增加了有利因素。但“特别费”的起诉，亦激起了马英九对民进党操弄政治的愤慨；背水一战的处境，则更激发他的旺盛斗志；国民党内因危机而团结，也有极大意义。社论最后点明，对于检察官如何查民进党“四大天王”的“特别费”，大家正拭目以待。