吉尔吉斯意为“草原上的游牧民”。关于其族源说法不一，早期民族史与匈奴、丁零、乌孙、塞种人等有联系，后因蒙古人进入哈萨克斯坦和中亚地区，部分突厥部落逐渐向西迁徙，往南直到帕米尔山脉后形成民族，今天吉尔吉斯大部分从西汉一直到西晋都属于中国版图，唐朝再次纳入中国版图，元朝时为蒙古族察合台汗国领土，清朝时再次纳入中国版图，东部和南部大部分地区属于中国新疆，西部属中国清朝藩属国浩罕汗国。从西汉汉武帝时，今天吉尔吉斯大部分首次纳入中国版图：汉武帝刘彻又命李广利于太初元年(前104年)、三年两伐大宛(在今中亚费尔干纳盆地)，使西域的许多土地成为中国领土。太初三年(前102年)战胜大宛后，西汉在轮台(今新疆轮台东)、渠犁(今新疆库尔勒西南)置使者、校尉，这是西汉政府在西域设置行政机构之始。后又设置伊循都尉、护鄯善以西使者。后来扩大统治范围，“最凡国五十”，西至今巴尔喀什湖以东、以南的乌孙，今铂尔河上游的大宛，今帕米尔地区的无雷，今阿赖谷地的休循等国，都受其管辖。“汉之号令班西域矣”，西域正式纳入了西汉王朝的版图。1864年10月7日，俄国强迫清国签订《中俄勘分西北边界条约》，强行割让中国新疆西部44万平方公里领土，其中就包括原来的中国领土，现今吉尔吉斯斯坦的大部分土地。1876年清朝藩属国浩罕汗国被沙俄吞并，至此，原来的中国领土、吉尔吉斯全部土地被沙俄吞并。唐朝贞观十四年(640年)设置安西都护府。治所西(今新疆吐鲁番东高昌故城)，统安西四镇，龟兹、疏勒、于阗、碎叶(今吉尔吉斯斯坦的托克马克市)，辖境相当今新疆及哈萨克东部、吉尔吉斯北部楚河流域。自显庆元年(656年)至麟德元年(664年)，这期间，是武则天为皇后辅佐高宗到垂帘听政阶段。显庆、龙朔年间(661-663年)，唐军平定西突厥，辖区扩大至今阿尔泰山西至咸海及葱岭的东西各部直至阿姆河两岸城的诸城邦国,包括今吉尔吉斯斯坦大部分。唐朝咸亨元年(670年)，安西都护府治所移至碎叶城。15世纪后半叶吉尔吉斯民族基本形成。16世纪受沙俄压迫，自叶尼塞河上游迁居至现居住地。1917年建立苏维埃政权；1926年成立自治共和国；1936年12月5日成为加盟共和国；1990年12月12日共和国发表“主权宣言”；1991年8月31日宣布独立。