15世纪末，葡萄牙殖民主义者侵入几内亚湾沿海地区和比奥科、科里斯科和安诺本等岛。1778年西班牙占领比奥科岛，1843年占领木尼河地区，1845年建立殖民统治。1959年被划为西班牙的两个海外省。1963年12月西当局在赤道几内亚举行公民投票，通过“内部自治”法规。1964年1月实行“内部自治”。1968年10月12日宣告独立，定名赤道几内亚共和国，马西埃·恩圭马任总统。1979年8月国家革命人民武装力量部副部长奥比昂发动军事政变，成立以他为首的最高军事委员会。1982年8月奥比昂任总统，同年10月解散军委会。1988年在全国范围内进行了基层政权选举和议会换届选举。1989年6月25日举行全国大选，奥比昂再次当选为总统。1996年2月连任总统。