大约2千多年前，由“扬子江水出海后受海潮顶托，折旋而南，与钱塘江水在此交汇”而成陆，故称“南汇嘴”，曾称“海曲”、“南沙”。1386年(明洪武十九年)，明政府为御倭寇，在南汇嘴(今惠南镇)筑城设守御所。南汇成陆于唐代前后，1726年建县，建县时因县治设在原守御所南汇嘴，故县名“南汇”。

　　1949年5月16日，南汇解放后归苏南松江公署管辖，1958年11月，国务院决定将其改为上海市辖。解放以来，尤其是改革开放以来，南汇的国民经济和社会事业得到迅速发展，曾先后三次进入年财政收入超亿元(双亿元)的全国十大富县行列。2001年8月，正式撤县建区。