1980年6月24日，中共中央以中发（1980）65号文件，批准了中央组织部和解放军总政治部联合提出的关于为“新疆马明方案”平反的报告，该文件称：“事实证明，所谓‘新疆马明方叛徒集团案’，是林彪一伙和康生等人制造的一起冤案，应推倒强加给马明方、张子意等同志的一切不实之词，彻底平反，恢复名誉。”那么，这究竟是怎么一回事呢？

　　 迪化抗日 虎口脱身

　　 1937年10月，中国共产党与新疆边防督办盛世才建立了新疆抗日民族统一战线，同时，在省城迪化（今乌鲁木齐）设立了八路军驻新疆办事处，陈云为首任中共驻新疆代表兼八路军驻新疆办事处主任。此后，应盛世才的要求，我党相继抽调了70多名干部，由盛世才安排进新疆的群众团体、政府机关以及财税、文教、新闻、军事等部门工作。在继任中共驻新疆代表邓发（化名方林）、陈潭秋（化名徐杰）的领导下，他们克服了环境复杂、条件艰苦等诸多困难，严于律己，勤奋工作，坚决执行党的抗日民族统一战线，为巩固新疆这个全国抗日的大后方，保障新疆这条重要国际交通线的畅通，并为推动新疆的经济发展和社会进步，作出了很大贡献。与此同时，我党还从“新兵营”和延安抗大等处挑选了43名干部、战士进入新疆航空队学习飞机的驾驶和修理等技术。另外，在1939年秋至1941年夏期间，我党有一些残疾军人来到迪化养病，还有一批干部自苏联回国途经新疆时，由于经过兰州、西安去延安的道路被国民党顽固派重兵封锁，使他们被迫滞留于迪化。曾担任过中共陕北省委书记、陕北省首届苏维埃政府主席等职，并于1938年赴苏联治病和学习的马明方，在1941年回国时，也被阻于此。遵照党中央的指示，他在八路军驻新疆办事处担负起党支部书记的职责。

　　 本质上善于趋炎附势、政治投机的盛世才，其结好苏联、联合中共的根本目的是想夯实他在新疆的统治基础，巩固他在新疆的“土皇帝”地位。

　　 国内抗战进入相持阶段后，国民党顽固派不断掀起反共逆流，制造了震惊中外的“皖南事变”。中国共产党及其领导下的八路军处境维艰；国际上，由于苏联被卷入第二次世界大战，自身难保，无暇东顾，更无能为盛世才当局提供帮助了。于是，盛世才决定更换门庭，投靠蒋介石，大举反苏反共。

　　 1942年9月初，盛借口“容易保护与免被国民党发觉”，先是将分住在羊毛湖、“新房子”招待所和八路军驻新疆办事处的中共党员，全部集中在八户梁原土产公司的一个仓库院内，继之又分批将他们软禁起来，使未及撤离的在新疆的中共党员及其家属子女128人全部失去自由。

　　 自1943年2月7日夜起，盛世才撕去伪装，正式抓人，至4月13日，入狱的中共党员干部已达60人。

　　 自3月10日起，蒋介石派驻迪化的所谓“特派新疆审判团”，伙同盛世才对狱中的中共党员进行了历时3个月的审讯迫害。期间，有15名中共人员被提审，其中对陈潭秋、毛泽民、林基路等人的刑讯逼供尤为惨烈。但陈潭秋等人始终坚贞不屈、据理驳斥，使敌人的多项阴谋归于破产。9月27日，经请示蒋介石批准后，盛世才最终以莫须有的“危害民国”罪，将陈潭秋、毛泽民和林基路秘密杀害。

　　 为了抗议敌人的虐待和暴行，狱中的中共党员发动联合绝食斗争，另外，狱中党组织看穿了盛试图以当“工犯”的手段来收买中共同志的诡计，便领导大家坚决抵制，也取得了胜利。

　　 盛世才调离新疆后，吴忠信于10月初被蒋介石任命为新疆省主席。上台伊始，他就把盛世才软禁的中共人员几乎全部投入监狱。

　　 在吴忠信集中精力对省政府实施改组之际，处于混乱中的监狱就非常有利于被集中关押在各牢房的中共党员之间的联系。于是，以张子意、马明方等为核心的狱中党组织在总结前一阶段的斗争经验与教训的基础上，制订了新的对敌斗争方针与策略，适时提出了“百子一条心，集体无条件释放回延安”的口号，使全体中共党员更加紧密团结起来，连续开展了三次大规模的反普遍审讯斗争和集体绝食斗争，有力地揭露了盛世才残酷杀害陈、毛、林的罪行，挫败了国民党策反中共人员的图谋。

　　 中共党员在新疆被软禁关押的消息，很快即由共产国际转递给中共中央，党中央又迅速电请在八路军驻重庆办事处工作的周恩来设法营救。经多方努力，国民党当局迫于压力，遂于1946年4月同意释放新疆在押中共人员。

　　 历经一个月的长途跋涉，行程3000多公里，这批被释放的人员终于在7月11日胜利回到延安。不久，马明方、张子意除向刘少奇口头汇报了中共人员在新疆狱中斗争的情况而外，还认真深入总结经验教训，写出了《在新疆监狱中反法西斯斗争经过报告》，报送中央组织部。原新疆航空队中共党支部提交了《航空队党支部关于在新疆学习与生活情况给中央的报告》。经过3个月的休整之后，这批中共党员，又奉命奔赴新的工作岗位，为中国人民的解放事业作出了新的贡献。