由于周边地区生态恶化，从20世纪60年代至今，敦煌市鸣沙山月牙泉水位总下降幅度达6至7米，水域面积大幅缩减。为拯救鸣沙山月牙泉这一神奇的大漠景观，总投资4100万元的月牙泉水位下降应急治理工程，于2007年初正式启动运行。应急治理工程在月牙泉周围修建四个渗水场向地下渗水，通过提高月牙泉周围的地下水位，保持并提高月牙泉的水位。这一工程预计2008年5月完工，届时月牙泉水位有望得到稳定并逐步提升。